液相色谱系统的许多问题都可以在谱图上反映出来。其中有一些问题可以通过改变设备参数得到解决；而其他的问题必须通过修改操作程序来解决。对于色谱柱和流动相的正确选择是得到好的色谱图的关键所在。
下面给大家提供一些解决异常峰的办法。
原因
1)筛板阻塞；
2)色谱柱塌陷；
3)干扰峰；
4)流动相pH选择错误；
5)样品与填料表面的溶化点发生反应；
解决办法
1)反冲色谱柱或更换进口筛板；
2)填充色谱柱或更换色谱柱；
3)改变流动相或更换更长色谱柱；
4)调整pH值，对于碱性化合物，低pH值更有利于得到对称峰；
5)加入离子对试剂或碱性挥发性修饰剂或更改色谱柱。
基线漂移
原因
1)柱温波动。(即使是很小的温度变化都会引起基线的波动。通常影响示差检测器、电导检测器、较低灵敏度的紫外检测器或其它光电类检测器)；
2)流动相不均匀。(流动相条件变化引起的基线漂移大于温度导致的漂移)；
3)流通池被污染或有气体；
4)检测器出口阻塞。(高压造成流通池窗口破裂，产生噪音基线)
5) 流动相配比不当或流速变化。
6)柱平衡慢，特别是流动相发生变化时。
7)流动相污染、变质或由低品质溶剂配成。
8)样品中有强保留的物质(高k’值)以馒头峰样被洗脱出，从而表现出一个逐步升高的基线。
9)使用循环溶剂。未调整检测器。
10)检测器没有设定在最大吸收波长处。
解决办法
1)控制好柱子和流动相的温度，在检测器之前使用热交换器。
2)使用HPLC级的溶剂，高纯度的盐和添加剂。流动相在使用前进行脱气，使用中使用在线脱气或氦气脱气。
3)用甲醇或其他强极性溶剂冲洗流通池，如有需要，可以用1N的硝酸。(不要用盐酸)
4)取出阻塞物或更换管子。参考检测器手册更换流通池窗。
5)更改配比或流速。为避免这个问题可定期检查流动相组成及流速。
6)用中等强度的溶剂进行冲洗，更改流动相时，在分析前用10～20倍体积的新流动相对柱子进行冲洗。使用离子对试剂、缓冲盐更应注意平衡柱。
7)检查流动相的组成。使用高品质的化学试剂及HPLC级的溶剂。
8)改变分析条件。使用保护柱，如有必要，在进样之间或在分析过程中，定期用强溶剂冲洗柱子。
9)重新设定基线。使用新的流动相。
10)将波长调整至最大吸收波长处。重选检测波长。
出现鬼峰
原因
1) 进样阀残余峰；
2)样品中未知物；
3)柱未平衡；
4)三氟乙酸氧化；
5)水污染(反相)。
解决办法
1)每次用后用强溶剂清洗阀，改进阀和样品的清洗;
2)处理样品；
3)重新平衡柱,用流动相作样品溶剂(尤其是离子对色谱);
4)每天新配，用抗氧化剂;
5)通过变化平衡时间检查水质量，用HPLC级的水。
所有的峰面积都太小
原因
1)检测器衰减设定过高；
2)检测器时间常数设定太大；
3)进样量太少；
4)记录仪连接不当。
解决办法
1)减少衰减的设定；
2)设定较小的时间常数；
3)增大进样量；
4)使用正确的连接。
所有峰面积都太大
原因
1)检测器衰减设定过低；
2) 进样过多；
3)记录仪连接不正确。
解决办法
1)采取较大的衰减；